Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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