Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms