Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms