Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms