Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms