Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms