Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms