Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms