Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSEN1P49768 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSEN1P49768 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSEN1P49768 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSEN1P49768 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSEN1P49768 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSEN1P49768 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSEN1P49768 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms