Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms