Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD38P28907 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD38P28907 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD38P28907 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD38P28907 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms