Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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