Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD1P28340 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD1P28340 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms