Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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