Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBL4AP11441 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBL4AP11441 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBL4AP11441 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBL4AP11441 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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