Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRFP10586 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms