Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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