Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCATO75600 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCATO75600 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCATO75600 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCATO75600 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms