Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms