Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGSM2O43147 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms