Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms