Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DDIT4Q9NX09 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms