Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms