Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms