Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms