Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms