Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00523Q86TU6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms