Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM198BQ6UWH4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms