Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms