Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms