Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPY1Q3B7I2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms