Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms