Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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