Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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