Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPTX1Q15818 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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NPTX1Q15818 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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NPTX1Q15818 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPTX1Q15818 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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