Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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