Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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