Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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