Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms