Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms