Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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