Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms