Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTBP2P56545 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms