Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPAP53621 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPAP53621 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPAP53621 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPAP53621 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms