Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms