Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP3P42574 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP3P42574 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP3P42574 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP3P42574 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms