Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPB2P35606 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPB2P35606 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPB2P35606 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms