Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RYKP34925 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYKP34925 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms