Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms