Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PLNP26678 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PLNP26678 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PLNP26678 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PLNP26678 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PLNP26678 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms